控制科學與工程學院的前身工業企業電氣化專業由我國著名控制理論學者王眾托院士為首的學術隊伍于1956年創建，1994年工業企業電氣化與化工自動化兩專業合并成立自動化系，2009年在原自動化系的基礎上擴建為控制科學與工程學院。
學院于1956年開始招收本科生、1986年開始培養碩士研究生、2000年開始培養博士研究生、2003年建立博士后流動站；已為國家培養本科生萬余人、碩士千余人、博士近百人，博士后10余人；在讀本科生400余人、碩士生300余人、博士生70余人。學院設有“控制科學與工程”博士后流動站，“控制科學與工程” 一級學科博士點，“控制科學與工程”一級學科碩士點， “控制理論與控制工程”遼寧省重點學科，“遼寧省工業裝備先進控制系統重點實驗室”、 “教育部工業裝備監測與控制工程研究中心”、“ 遼寧省工業裝備分布式控制工程技術研究中心”、“ 大連市工業裝備節能控制工程實驗室”和“大連市工業無線傳感器網絡工程實驗室”。
學院下設自動化研究所、智能控制研究所、先進控制研究所、計算機控制研究所、模糊信息處理與機器智能研究所。學院現有專任教師60人，其中教授20人、副教授26人、具有博士學位教師53人、國家杰出青年基金獲得者2人、優秀青年基金獲得者2人、教育部長江學者1人、青年長江學者1人、青年QR1人、國家級有突出貢獻的中青年專家1人、教育部跨世紀人才1人、教育部新世紀人才1人。
控制學科的研究領域一直是國際、國內最活躍、發展速度最快的重要領域之一。近年來，本學科以流程工業建模與集成優化控制、復雜工業過程綜合自動化、工業以太網現場總線控制系統、模糊控制、智能機器人和無線傳感器網絡為主要研究方向，在國內外核心期刊發表論文500余篇，完成或正在承擔國家自然科學基金重點項目、國家“863計劃”重點課題、國家“十五”科技攻關項目、國家重大基礎研究項目(973)、國家十一五重大科技專項課題、國家十二五重大科技專項課題、國家自然科學項目、教育部骨干教師基金、遼寧省重大科技攻關項目等50余項。本學科教師曾獲得國家科技進步二等獎(2000年)、國家技術發明二等獎（2009年）、教育部自然科學一等獎（2002年）、教育部自然科學二等獎（2005年、2007年）、教育部科技進步二等獎(1998年)、國家冶金工業局科技進步一等獎(1998年)、遼寧省科技進步一等獎(1998年) 、遼寧省科技進步二等獎（2004年）、中國石油和化學工業協會科學技術二等獎（2006年）、中國標準創新貢獻一等獎（2008）、電子信息科學技術二等獎（2009）等20余項。通過參加多項國家級科研項目，本學科在科學研究、高技術攻關和企業自動化工程項目方面積累了豐富的經驗，為學科的進一步發展打下了堅實的基礎。本學院成功承辦了“2001年中國控制會議”、“2003年IFAC（國際自動控制聯合會）冶金自動化國際學術會議”、“2006年全球智能控制與自動化大會”、“2010年中加計算智能、控制與自動化雙邊研討會”和“2010年國際智能控制與信息處理會議”，使本學科在國內外有了很大的影響，其發展速度之快為國內外同類專業的學校所關注。
目前，全院師生以《胡錦濤在清華大學百年校慶上的講話》、《國家中長期教育改革和發展規劃綱要》、《大連理工大學中長期發展戰略規劃》及《大連理工大學“十二五”規劃》為指南，把“大力提升人才培養水平，大力增強科學研究能力，大力服務經濟社會發展，大力推進文化傳承創新”作為總的建設目標，把教師隊伍建設、高級人才培養、科研創新能力和國際合作交流作為學科建設主要內容，夯實基礎，抓住機遇，力爭經過十二五期間的努力，使我校控制學科在國內外具有相當的影響，綜合實力達到國內高校同類專業的一流學科水平。